甲午战争时的袁世凯：
袁世凯在朝鲜十二年，对日本人处处设防，日本人在朝鲜的活动经常会被监视，而且袁世凯深得李鸿章信任。他虽然年轻，不过处事果断，手腕老辣狠毒，日本人对其是恨之入骨的。
历经十二年的蛰伏，日本人的实力在迅速的增长，而清政府方面则裹足不前。北洋舰队在1888成军后再未购买过军舰，而1891户部又下令停止购买枪炮弹药，这无疑使得清政府对日本仅存的有一丝威慑意义的北洋舰队也日益衰败。而人员方面，湘淮军的元老大员左宗棠、彭玉麟、曾国荃、张树声、潘鼎新、曾纪泽等也都不断去世，清政府人才出现了青黄不接的局面。
1894年朝鲜爆发东学党起义，面对风起云涌的东学党起义，朝鲜国王及其军队是一片慌乱，而且在镇压的战斗中是兵败如山倒。在无奈之下，最后通过袁世凯请求清政府出兵援助镇压起义。袁世凯在朝鲜爆发东学党起义时，就劝朝鲜政府要重视，要及早解决。无奈李熙政府懦弱无能，处事犹豫不决，错失了最佳的机会。对于东学党这类类似于白莲教的神教组织，袁世凯的建议是要治标又治本。一方面要武力威慑和镇压，而如何威慑镇压也是有讲究的。如果对自己的实力有绝对的自信，那么可以高高举起，以震慑敌之心理。如果事情发展到很乱的程度，那只能强力解决了。另外就是要慎选地方公正官吏，让民众安心，让民众看到政治改良的成果。还有就是分化瓦解，只处首恶而不追究胁从。认为这类组织关键在于信徒对首恶的迷信力度，如果剪除首恶会如鸟兽散。不得不说，袁世凯的分析是很有道理的。日后他在山东镇压义和团就是如此办法。
镇压不力之时，也暗示朝鲜请求清政府出兵。清政府出兵，根据条约也通知了日本。清政府出兵的规模是两千多人，而且入朝作战后的确迅速解决了战事。战事平定后，清政府已经要撤军，但日本方面却不断增兵。日本对于东学党起义的情况是十分了解的，因为东学党事情越闹越大，与日本人的不断挑事儿也有密切的关系。日军时任参谋次长的川上操六就派玄洋社（日后黑龙会的前身之一）的内田良平等渗透到朝鲜东学党内部，鼓励其闹事，而且不断把斗争方向由李熙政府和日本方向转移到清政府方面。
朝鲜的局势在日本的挑唆下是越来越严重，已经超出了清政府的想象。袁世凯在朝鲜的官署的人也是越来越少，后来只剩下几个人了，而日军则不断增兵。袁世凯相当于是手无寸铁孤身独处虎口，缺乏军力的支援。袁世凯曾致电驻朝的直隶提督叶志超部，请他南下，或者是散布清军要南下的消息，起码可以暂时迷惑牵制日本方面。但是清政府、李鸿章当时都醉心于列强调停，没有下令南下。袁世凯不断给李鸿章发电，认为自己留在朝鲜已经没有作用，死也无益，请求回国。7月18日，终于得到可以回国的电令，7月19日，袁世凯化装成平民逃走，7月22日抵达天津。
在袁世凯出走前，日本人已经将袁世凯官邸寓所包围，并有人密谋刺杀袁世凯。鉴于当时袁世凯还有外交身份，日本人不能直接出面暗杀，就利用鼓动东学党的人员来刺杀。同时逼迫朝鲜放弃与中国的藩属朝贡关系地位，这样就可以摆脱控制，同时袁世凯的外交身份也就会丧失，更方便刺杀。袁世凯的好友时任驻龙山商务委员的唐绍仪得知消息后立即赶往立即跑至英国使馆，求救于英驻朝公使朱尔典，共同策划了一个救袁方案。当晚，袁世凯改装易服，从使馆后门出走。唐绍仪身配双枪双刀，骑马护送袁世凯到汉江边，登上朱尔典准备的英国兵舰。这时，距离日本人密谋动手的时间只差十几分钟。
袁世凯甲午战争对于日本人的野心其实是有所了解的，但袁世凯纵然有智谋权术，没有驻军的强硬支持，也无济于事。而日本人为了发动战争，十多年来确实进行了周密的准备。甲午战争开始后，袁世凯于8月6日奉旨前往辽东前线，协助周馥转运粮械、收集溃卒等后勤事宜，至次年5月请假回籍省亲。在整个战争中，袁世凯一直办理后勤事宜。在办理后勤的事宜中，袁世凯处事精明细心，曾提醒驻军在取用粮食方面要注意根据季节和饮食习惯，还要注意分辨粮食的新鲜程度。同时也发现淮军等旧式军队的腐败无能，萌生了由自己用西法练兵的想法。
