前面说到阴间的一些管理鬼的部门。阴间管理鬼的部门不仅有以上的高层管理部门，还有许多中下层管理部门。以下就是一些阴司的中下层管理部门。
六案功曹：功曹司是阎王殿的秘书处，它是呈报阴司公文，传达诏令。功曹六部为天曹、地曹、冥曹、神曹、人曹、鬼曹。
判官司：主管查案，管人生死。制阴律，赏善罚恶。四大判官司分别为：赏善司（魏征）、罚恶司（钟馗）、查察司（陆之道）、阴律司（崔珏）。
阴曹司：阴曹司主事为城隍，城隍是冥界分管各地的地方官，下设十二司，有监察阴阳两界的职责。
轮回司：地府中专门管魂鬼轮回，主事职务为泰媪（孟婆），提供孟婆汤消除魂鬼记忆，送魂鬼入轮回。
十大阴帅：地府鬼差，负责阴阳两界巡视、阳间拘魂。阴鬼使有鬼王（鬼兵头目）、日游巡使、夜游巡使；拘魂使有白无常（谢必安）、黑无常（范无救）、牛头（阿傍）、马面（罗刹）；豹尾（拘捕走兽魂魄）、鸟嘴（拘捕飞鸟魂魄）、鱼鳃（拘捕游鱼魂魄）、黄蜂（拘捕爬虫魂魄）。
阎王是阴间的天子，掌管人间生老病死，统辖黑无常、白无常和催命判官等勾魂鬼。他们的麾下分设五官职能：鲜官禁杀、水官禁盗、铁官禁淫、土官禁两舌、天官禁酒，构建阴律惩戒体系。
虽然阴司也有严格的法律体系，但是跟天上和人间一样，在执法方面也存在不少问题。从天上来看，神仙的等级是很森严的。但是碰到孙悟空也就无法维持天界秩序了。孙悟空本来在花果山做他的猴王，日子过得逍遥自在。但是天上一些神仙就向玉皇大帝反映，这孙悟空不过是一只猴子，却打起齐天大圣的旗号，在花果山闹得个天翻地覆。那孙悟空每日里东游西荡，结交四方英雄豪杰，要是闹出事来，只怕会造成天下大乱，还得早早堤防。玉皇大帝要大家讨论，有什么办法让那孙悟空安于本分不闹事呢？就有赤脚大仙献策，要使那孙悟空老实本分，用武力弹压只怕不行，据说他那根如意金箍棒有十万八千斤，而且可大可小，变化无穷，最是难以抵敌。不如给他封一个官职，让他到天庭来任职，只怕他就老实本分了。
仙官们都认为赤脚大仙的建议好，于是玉皇大帝就封孙悟空为弼马温。孙悟空收到玉皇大帝的任命书，非常高兴，就跟着赤脚大仙到了玉皇宫的凌霄宝殿，办理了任职手续，就到天庭御马监正式上班了。
开始的几天还好，每天到处走走，看看奴役们给马儿喂草料，看看马儿互相嘻戏，或者看着公马和母马交配。这一天，孙悟空忽然想到一个问题，这弼马温到底是个什么官？是几品几级？于是孙悟空就问付监：“哎哎，这弼马温是几品官？”
“没有品。”
“是几级？”
“没有级。”
“无品无级，应该是最大的官？”
副监笑了。但是不说话。孙悟空问：“你笑什么？”
“我不敢说，我怕你打。”
孙悟空拉着付监的手说：“我不打你，你告诉我，这弼马温到底是个什么官，是大官还是小官。”
付监说：“弼马温这个官并不是官，而是一个养马的奴役们的头儿。”
孙悟空听了付监的话，大怒道：“玉帝老儿，竞敢糊弄我老孙，我不干了！”于是脱去官服气愤地回到了花果山。
孙悟空居然敢违抗玉皇大帝的命令，这可是弥天大罪啊，于是玉皇大帝命令李天王率领天兵天将前往花果山抓捕孙悟空，被孙悟空打到凌霄宝殿，玉皇大帝没有办法了，只得请求西天如来佛帮忙。最后是如来佛施展阴谋诡计，把孙悟空压在五指山下才了事。
孙悟空的故事也说明天上仙界虽然有严格的法律，但是归根结底还是靠武力说话。尽管玉皇大帝位高权重，但是碰到孙悟空也就没有办法了。
阴司的情况也跟人间的情况差不多。唐太宗本来已经阳寿该终，掌管生死簿子的崔判官生前是唐太宗的臣子，现在在阴司任判官，为了报答唐太宗对自己的知遇之恩，居然修改生死簿子，把唐太宗的阳寿加了二十年。对崔判官的舞弊行为，阎王秦广王也睁只眼闭只眼。这说明在阴司也存在着严重的舞弊行为，导致人间出现许多死而复生的故事。
