平静的日子并没有持续太久。
三个月后，珍珠在一次深海探测中，发现了一个令人震惊的现象 —— 马里亚纳海沟附近的海水温度正在异常升高，而且海水中出现了大量未知的微生物。这些微生物具有很强的攻击性，能够快速分解金属和生物组织。
珍珠立刻将这个发现告诉了小满和小岸。小岸听完后，立刻前往深海探测：“妈妈，珍珠阿姨，这些微生物很奇怪，它们似乎是被某种外力唤醒的。而且，我在深海中感受到了一股熟悉的能量，和当初科研站的未知基因序列很像，但又有所不同。”
珍珠的机械义眼快速闪烁，她调出深海探测数据：“根据分析，这些微生物是由未知基因序列变异而来的，它们正在以惊人的速度繁殖。如果不加以控制，不出一个月，整个太平洋的海水都会被这些微生物污染，所有的海洋生物和沿海居民都会受到威胁。”
小满的脸色变得凝重：“我们必须尽快找到控制这些微生物的方法。小岸，你能通过海洋生物找到这些微生物的源头吗？”
小岸点点头：“我可以试试。小鱼们告诉我，这些微生物是从马里亚纳海沟深处的一个裂缝中出来的。我想，那里一定有什么东西在控制着它们。”
当天下午，小岸、小满和珍珠带领一支精锐的 “海魂军” 队员，乘坐改装后的潜艇 “深海守护者号”，朝着马里亚纳海沟出发。潜艇缓缓驶入深海，周围的海水温度越来越高，海水中的微生物也越来越多。
“目前深度 10000 米，接近马里亚纳海沟深处。” 驾驶员报告道。
小岸站在观察窗前，闭上眼睛，与周围的海洋生物进行交流。片刻后，他睁开眼睛：“妈妈，珍珠阿姨，我们快到了。裂缝就在前方 500 米处，那里有一股强大的能量在控制着微生物。”
潜艇继续前进，很快就到达了裂缝附近。透过观察窗，众人看到一个巨大的裂缝出现在海沟底部，裂缝中不断涌出大量的微生物，而且还散发着一股诡异的红光。
“这些红光就是控制微生物的能量来源。” 珍珠的机械臂操控着探测仪器，“根据分析，这股能量来自裂缝深处的一个未知装置，它正在不断释放能量，唤醒更多的微生物。”
小岸突然指向裂缝深处：“妈妈，你看！那里有一个巨大的金属建筑，和之前的科研站很像，但比科研站大得多！”
众人顺着小岸指的方向看去，果然看到一个巨大的金属建筑隐藏在裂缝深处。建筑的外墙上，刻着一个陌生的徽章 —— 一个由基因链和齿轮组成的图案。
“这个徽章我从未见过。” 珍珠皱着眉头，“它既不属于国际基因管控组织，也不属于黑水群岛的‘新基因秩序党’。看来，我们又遇到了新的敌人。”
浪的声音突然在小岸的脑海中响起：“小岸，小心那个建筑，它是‘普罗米修斯计划’的终极基地，里面隐藏着足以毁灭世界的秘密。”
小岸惊讶地睁开眼睛：“妈妈，我听到爸爸的声音了！他说这个建筑是‘普罗米修斯计划’的终极基地，里面有很危险的东西。”
小满和珍珠都震惊不已，他们没想到浪的意识竟然还能与小岸沟通。珍珠立刻说道：“这一定是因为小岸继承了浪的基因，所以才能接收到浪残留的意识。我们必须小心行事，不能轻易进入建筑。”
就在这时，潜艇的警报系统突然响起，屏幕上显示出大量的红点正在从金属建筑中涌出。“是基因改造人！数量很多，而且它们的身体中含有大量的未知微生物！” 驾驶员大喊。
小岸立刻下令：“启动防御系统，准备战斗！海洋护卫队，请求支援！”
很快，大量的变异海洋生物赶到，与基因改造人展开了激烈的战斗。但基因改造人异常强大，它们身体中的微生物能够快速腐蚀海洋生物的皮肤，许多海洋生物都受到了重伤。
“这样下去不是办法，我们的防御系统撑不了多久。” 珍珠焦急地说，“小岸，你能感受到建筑内部的能量来源吗？我们必须摧毁它，才能阻止微生物的扩散。”
小岸闭上眼睛，集中精神感受着建筑内部的能量。片刻后，他睁开眼睛：“能量来源在建筑的中央控制室，那里有一个巨大的能量核心。但核心周围有强大的防护罩，我们根本无法靠近。”
浪的声音再次在小岸的脑海中响起：“小岸，用你的血液，你的血液中含有纯净的 HS-38 基因，能够破解防护罩。记住，一定要在能量核心完全激活前摧毁它，否则后果不堪设想。”
小岸立刻对小满和珍珠说：“妈妈，珍珠阿姨，爸爸说用我的血液可以破解防护罩。我必须进入建筑，摧毁能量核心。”
小满坚决反对：“不行，太危险了！你不能去！”
珍珠也劝道：“小岸，我们再想想其他办法，一定有其他办法可以摧毁能量核心。”
小岸摇摇头：“没有时间了，微生物的繁殖速度越来越快，再拖延下去，整个太平洋都会被污染。妈妈，珍珠阿姨，相信我，我一定能成功的。”
小满看着小岸坚定的眼神，想起了浪当年的模样，最终还是妥协了：“好，妈妈相信你。但你一定要小心，我们会在外围掩护你。”
小岸点点头，穿上特制的潜水服，带着一把由浪的鲨鱼匕首改造而成的武器，朝着金属建筑游去。基因改造人发现了小岸，纷纷朝着他扑来。小岸灵活地躲避着攻击，同时用匕首不断攻击基因改造人的弱点。
在小满和珍珠的掩护下，小岸成功进入了金属建筑。建筑内部布满了复杂的通道和仪器，空气中弥漫着一股刺鼻的气味。小岸按照浪的指引，朝着中央控制室前进。
很快，小岸就到达了中央控制室。中央控制室的中央，有一个巨大的能量核心，散发着诡异的红光。核心周围有一层透明的防护罩，上面布满了复杂的基因图案。
小岸按照浪的指示，用匕首划破自己的手掌，将血液滴在防护罩上。当血液接触到防护罩时，防护罩上的基因图案开始逐渐消失，防护罩也变得越来越透明。
“就是现在！” 小岸大喊，他举起匕首，朝着能量核心刺去。
能量核心被匕首刺中，发出一声巨响，红光瞬间消失。整个金属建筑开始剧烈震动，大量的石块从天花板上掉落。小岸知道，建筑即将崩塌，他立刻转身朝着出口跑去。
当小岸冲出建筑时，小满和珍珠立刻驾驶潜艇朝着他驶来。小岸跳进潜艇，潜艇迅速撤离。就在他们离开后不久，整个金属建筑在海沟中化为一片废墟。
潜艇上，小岸看着逐渐恢复正常的海水，脸上露出了笑容：“妈妈，珍珠阿姨，我们成功了！微生物的繁殖已经停止了，海水正在逐渐恢复纯净。”
小满抱着小岸，泪水再次滑落：“小岸，你做到了！你爸爸一定会为你骄傲的。”
珍珠的机械义眼闪烁着欣慰的光芒：“小岸，你不仅拯救了渔村，还拯救了整个太平洋。你是真正的英雄，就像你爸爸一样。”
