林微和苏然商议妥当后，便各自投入到紧张的行动之中。林微深知，当务之急是要尽可能保护更多核心人员免受改良版天花病毒的侵害。她突然想起在现代医学知识里，牛痘疫苗对预防天花有着显著效果，或许这能成为破解当下危机的关键。然而，在古代宫廷要实施牛痘接种，困难重重。
林微先是向太医院的太医们说明了自己的想法，希望得到他们的支持与协助。但太医们听后，皆是一脸茫然与怀疑。一位资深太医皱着眉头说道：“林医官，这牛痘接种之法，我等闻所未闻。将牛身上的东西接种到人的体内，这岂不是荒谬至极？万一出了差错，谁能担得起这责任？” 其他太医也纷纷点头表示赞同，对林微的提议充满顾虑。
林微耐心地向太医们解释牛痘接种的原理：“各位太医，牛痘病毒与天花病毒相似，人体接种牛痘后，免疫系统会产生相应抗体，从而对天花病毒产生免疫力。在我家乡，这方法已经过多次验证，十分有效。如今我们面临如此严峻的病毒危机，实在是没有更好的办法了。” 尽管林微说得头头是道，但太医们依然犹豫不决。
此时，外面喊杀声愈发激烈，沈贵妃的部队逐渐逼近。林微心急如焚，她知道不能再等了。她决定先从太医院内部开始，说服一些年轻且思想较为开放的太医参与牛痘接种试验。林微找到平日里与自己关系较好的张太医和李太医，向他们详细阐述了牛痘接种的科学性，并保证会全程负责。在林微的劝说下，张太医和李太医终于决定尝试。
林微立刻着手准备牛痘疫苗。她让人从宫外找来健康的奶牛，亲自采集牛痘浆液。在采集过程中，林微严格按照记忆中的操作规范，确保浆液的纯净与活性。采集完成后，林微对浆液进行了一系列处理，制成了适合接种的疫苗。
在太医院的一间密室里，林微为张太医和李太医进行了牛痘接种。接种过程中，张太医和李太医都十分紧张，但看到林微镇定自若的样子，他们也渐渐安心。接种完成后，林微密切观察两人的反应，每隔一段时间就为他们检查身体状况。
起初，张太医和李太医出现了一些轻微的发热、局部红肿等症状，这让其他太医们更加担忧，纷纷指责林微的方法太过冒险。林微却心中有数，她知道这是接种疫苗后的正常反应，只要熬过这一阶段，就能产生免疫力。在林微的悉心照料下，张太医和李太医的症状逐渐减轻，身体也慢慢恢复正常。
看到两人平安无事，其他太医们的态度开始有所转变，一些原本反对的太医也开始动摇。林微趁热打铁，向他们展示了张太医和李太医接种疫苗前后的身体变化数据，进一步证明牛痘接种的安全性和有效性。在事实面前，越来越多的太医选择相信林微。
接下来，林微计划将牛痘接种推广到皇帝、太后以及其他皇室核心成员和重要大臣身上。她和苏然商议后，决定先面见皇帝，向皇帝说明情况。此时，皇帝和太后在密室中焦急地等待着消息，听闻林微求见，立刻宣她进来。
林微见到皇帝和太后，行礼后便将牛痘接种的计划详细告知。皇帝听后，沉思片刻，说道：“林医官，此方法虽闻所未闻，但如今局势危急，朕愿意一试。只是，这关乎皇室安危，切不可有半点马虎。” 太后也说道：“林医官，你一定要确保万无一失，哀家可不想皇室成员再陷入危险之中。” 林微坚定地说道：“陛下，太后娘娘，请放心。民女一定会全力以赴，保证接种过程安全顺利。”
得到皇帝和太后的同意后，林微立刻开始筹备皇室成员的接种工作。她根据皇室成员的身体状况，制定了详细的接种计划。在接种过程中，林微遇到了一些阻力。有些皇室成员对这种陌生的接种方法心存恐惧，不愿意配合。林微和苏然耐心地向他们解释接种的必要性和安全性，经过一番努力，终于说服了所有人。
在为皇帝接种牛痘疫苗时，林微格外小心。她反复检查疫苗的质量和接种器具，确保万无一失。皇帝看着林微认真的样子，心中也安定了许多。接种完成后，皇帝在密室中休息，林微则时刻守在一旁，密切关注皇帝的身体状况。
随着接种工作的推进，越来越多的皇室成员和重要大臣成功接种了牛痘疫苗。在接下来的几天里，接种者们陆续出现了不同程度的接种反应，但都在林微的预料之中。在林微的精心照料下，大家都顺利度过了反应期，身体逐渐产生了对天花病毒的免疫力。
然而，沈贵妃的进攻并未停止。她得知林微在宫中推行牛痘接种后，心中大怒，下令加快进攻速度，企图在疫苗发挥作用之前控制皇宫。苏然带领暗卫们拼死抵抗，与沈贵妃的部队展开了激烈的战斗。双方在皇宫的各个角落展开厮杀，一时间，皇宫内硝烟弥漫，血流成河。
林微一边关注着接种者的身体状况，一边为受伤的士兵和侍卫治疗。她知道，自己不仅要保证疫苗接种的成功，还要为前线的抵抗力量提供医疗支持。在这艰难的时刻，林微充分发挥自己的医学才能，带领太医们救治了许多受伤的人，为抵抗沈贵妃的进攻争取了宝贵的时间。
随着时间的推移，接种了牛痘疫苗的皇室成员和重要大臣们逐渐恢复了健康，他们的身体对改良版天花病毒产生了抵抗力。这一消息让抵抗力量士气大振，大家纷纷鼓起勇气，与沈贵妃的部队展开殊死搏斗。而沈贵妃的部队中，由于没有有效的防护措施，越来越多的人感染了改良版天花病毒，战斗力逐渐削弱。
苏然抓住时机，带领暗卫们发动了一次猛烈的反击。他们突破了沈贵妃部队的防线，直逼沈贵妃所在之处。沈贵妃见势不妙，想要逃跑，但被苏然率领的暗卫团团围住。沈贵妃看着眼前的局势，心中充满了绝望，但她仍不甘心失败，恶狠狠地说道：“林微，苏然，你们别得意，我就算死，也不会让你们好过！”
苏然冷冷地说道：“沈贵妃，你的阴谋已经败露，今日就是你的末日。你犯下如此罪行，必须受到惩罚。” 就在沈贵妃还想负隅顽抗时，林微带着一群太医赶到了。林微看着沈贵妃，说道：“沈贵妃，你为了一己私利，做出这等伤天害理之事，如今后悔也来不及了。不过，我不会让你轻易死去，我要让你为自己的所作所为付出代价。”
沈贵妃被擒后，宫变终于得到了平息。皇宫内一片狼藉，但人们的脸上却露出了胜利的喜悦。林微通过牛痘接种，成功保护了核心人员免受天花病毒侵害，阻止了沈贵妃的阴谋进一步扩大。然而，林微知道，这场危机虽然暂时解除，但宫廷中依然存在着许多隐患，她和苏然还有很长的路要走……
