二十八日，明军收到报告，一股日军（岛津军）在庆尚道居昌等地劫掠，提督麻贵遂派遣副总兵解生、游击摆赛前去剿匪。俩人于三月一日出发，八日抵达全罗道的忠州，但摆赛在途中感染痰火，不能前进，于二十六日退回忠清道的振威，并最终因病去世。摆赛病故后，其所部兵马交给了解生统领，解生继续进剿滞留在庆尚道 的日军。
三月二十四日，解生率明军500人，与朝鲜将领郑起龙等人联合， 兵分两路，本路进至庆尚道的陕川、三嘉，西路则进至庆尚道的居 昌、憨八。解生屯兵陕川，郑起龙屯于三嘉。郑起龙侦察到岛津军在劫掠三嘉县境内的栗院，于是与 解生合兵进击。岛津军见状撤退，解生、郑起龙一路追击至三嘉县南 部。岛津军登上山头，扼守险要，郑起龙假装退军，将山头上的岛津军 引诱至平地，随后分兵夹击，击溃这股岛津军。此战，岛 津军一共有200多人，郑起龙斩得首级24颗，明军斩首72级，解救被俘虏的朝鲜男女150多人。而西路进至居昌、憨八以后，在此遭遇300余岛津军。由于此处道路狭窄，人马难行，岛津军据险防守、堵截路口，使明军难以放开手脚，最后仅仅斩获1颗首级。
四月九日，屯驻在泗川城的岛津军出城劫掠，向庆尚道的山阴、咸阳进军。朝鲜将领郑起龙与明军联合，击败了这些日军。
二十日，岛津军又劫掠庆尚道的居昌等地。明军副总兵李宁率领130余人前往咸阳沙斤驿迎战，战斗中，李宁被铁炮击中坠马，岛津军趁机冲上去乱砍乱斫，李宁当场殉国，尽管如此，明军仍然斩首日军300级。李宁也是万历朝鲜战争中阵亡的级别最高的明军将领，他在明军中以勇武出名，也曾是李如松麾下的家丁。
六月五日，泗川城内的岛津军又出城劫掠，400余日军沿水路从庆尚道发兵全罗道。登陆全罗道以后，岛津军分兵行动，沿途朝鲜民众官兵望风奔溃。岛津军进兵至草岘时， 数十名明军与朝鲜将领联合抵御，但是因为兵力不足，战斗失利。
七月二十日，董一元麾下的一支明军在高灵防范，击退了一股岛津军，俘虏一人。
七月二十三日，昆阳城的20多个岛津军潜至光阳的一条名为知分川的河流处，被明军击退。
同样在七月末，泗川城内的500名岛津军分为两队出城掳掠。朝鲜全罗道兵营别将佥裴敬南领军数百迎战，但是不敌岛津军很快溃败，于是向驻守全罗道全州的明军告急。明军提督董一元派兵数百，将岛津军击溃，斩首20级。 八月二十一日，这些战败的岛津军从全罗道撤军，逃回庆 尚道。明军游击蓝芳威派兵追击岛津军至咸阳，在此将其再次击破，斩首42级，夺回被岛津军俘虏的100多名朝鲜人与60余匹牛马。
与此同时全罗道的数千明军开始出动，进入庆尚道，泗川城内的岛津军听说明军大兵压境，派出侦察部队在庆尚道的山阴查探情况，但被蓝芳威再次击败，斩首40余级，岛津军再次败走。
八月十三日，一股明军在陕川袭击日军，生擒了一个日军哨兵。
八月末，晋州城的岛津军500人出城进兵至智异山，杀掠无数， 得知这个消息的蓝芳威再次派出明军将这股岛津军击溃。
这一时期，也不仅仅是岛津家，其他日军各部也和明军发生了冲突，双方在兴阳、竹岛、茂朱等地都有过交手，从蔚山之战后到明军再次南下之前，双方爆发了二十多次战斗，这些战斗中双方互有胜负，但明军的胜率占了其中的绝大部分，将日军打得再也没有了北上的气焰。
日军厌战情绪严重，明廷却继续增兵奔赴朝鲜，准备彻底荡平倭寇，四月二十七日，陈璘的广东兵到达辽东，刘綎的川军已经进入了朝鲜义州。五月十日，陈璘的广东兵开赴鸭绿江。到了五月中旬，明军援军全部进入朝鲜，再加上原先进入朝鲜的明军士兵，在朝明军总兵力达到9.8万人，这也是整个万历朝鲜战争期间明军人数的最大值。
但是，前面说过，明军内部也展开了派系斗争，杨镐命人捉拿了浙江游击陈寅标下的中军周升，并且打了军棍，周升为此深恨杨镐，对丁应泰诬告杨镐，六月四日，丁应泰上奏朝廷，弹劾经理杨镐、提督麻贵、副总兵李如梅，添油加醋的诋毁他们。朝鲜人都看不下去了，为杨镐等人伸冤，甚至不少明军将领都希望留下杨镐。杨镐也是朝鲜人评价最高的明军将领，对其十分敬重。
尽管如此，杨镐在蔚山之战因为最后撤退阶段指挥不当，判断失误，还是被撤了职回国，战争结束后官复原职。李如梅回辽东买马，前不久，抗日名将李如松在和蒙古人的战斗中殉国，由李如梅继任辽东总兵，在朝鲜的部下交给了董一元。离开朝鲜前，朝鲜国王李昖在弘济院为杨镐践行，并因他的离去伤心流泪，杨镐自己也凄然动容。朝鲜父老遮住道路，拦着不让杨镐走， 大声号哭，杨镐在轿子上鼓励、安慰他们后，流着泪离开了。
杨镐等人回国的同时，在蔚山之战被俘虏的日军将领十郎卫门也作为战犯被押回北京，交给了刑部尚书萧大亨，经过萧大亨等人审讯后，将其招供内容写成了两道奏疏上奏给万历皇帝，最后在万历皇帝的命令下，十郎卫门最终在北京西市被斩首示众，头颅被挂在墙上。
同样是在六月，战争的罪魁祸首丰臣秀吉也产生了结束侵朝战争的念头，他知道撑不下去了，他这个时候已经生了重病，命加藤清正与朝鲜交涉议和事项，只要朝鲜向日本道歉，日本就立刻撤兵。由此可见，蔚山战役过去仅仅半年，丰臣秀吉就有了结束侵朝战争的想法，他实在撑不下去了，再一次征明了蔚山之战对日军造成的打击非常巨大。
这个时候，明军内部也安定了下来，重整旗鼓准备再次南下扫荡日军，兵分四路，麻贵率领东路军，进攻岛山，董一元为中路，进攻晋州，泗川等地，刘綎为西路，陈璘率领水路，进攻顺天。
明军备战时，八月十八日，发动战争的罪魁祸首丰臣秀吉病逝，临死前要求撤军：“勿使我十万兵化作海外鬼”。消息也传到了朝鲜，德川家康等五大老也打算撤兵回国。
丰臣秀吉一死，标志着他那不稳固的政权即将完蛋，他的亲生儿子丰臣秀赖只有5岁，隐忍了多年的德川家康又在蠢蠢欲动，此时丰臣家内部也逐渐开始分裂。桃山时代，即将彻底成为历史，日本内部即将再次走向战乱。
