麻贵打算在朝鲜屯田的政策被朝鲜人得知后引起了激烈的抵抗，柳成龙认为明军在朝鲜屯田的话，这是独立于朝鲜以外的军政集团，朝鲜无权干涉，一旦遇上不好的明朝官员，朝鲜无法取缔，并且会让朝鲜国将不国。柳成龙建议李昖：既然明军前来救援，朝鲜还不如专心务农。随后，朝鲜人上报万历皇帝北方屯田不方便，建议明军去庆尚道和全罗道屯田，而此时庆尚道和全罗道的粮食产地要么被日军占领要么就是作战前线，朝鲜人是故意找借口委婉拒绝了明军屯田。
丰臣秀吉自从决定发动第二次侵朝战争以来，已经变得丧心病狂。他亲自下达了在朝鲜实行无差别屠杀的命令。根据日本史料《本山丰前守父子战功觉书》的记载，丰臣秀吉向加藤清正下令杀光朝鲜男女。《大河内秀元朝鲜记》则记载，丰臣秀吉向日军下令，在朝鲜，无论男女老幼还是僧人或世俗之人，全部杀死。于是本来之前就作恶不断的侵朝日军在丁酉再乱中大肆屠杀掳掠朝鲜百姓成为了常态，占领区几乎都被实行了三光政策。
杨元部3000 明军抵达南原时，在朝日军已经达到9万，后续部队还有5万余，仅凭在朝1万多人明军当然难以抵挡。吴惟忠私下告知金命元朝鲜暂时不要挑衅日本，等到明军大军到齐再计划。沈惟敬出发和小西和谈，被麻贵派杨元抓回，押解回王京，从此明军中再也没有和谈的声音。
七月八日，藤堂高虎，加藤嘉明，协坂安治率日军水军6400余人从釜山大本营出发，向闲山岛靠近。朝鲜三道水军统制使元均命令庆尚道右水使裴 楔以大船2艘为先锋，侦察日军动向，双方在熊川附近海域遭遇，随后开始激战，刚开始朝鲜水军放箭射死了很多日军士兵，日军抵挡不住，尽弃船只， 上岸逃走。朝鲜水军缴获了船上的200余石军粮，击毁日军战舰十余艘，但是很快，日本水军再次出动更多战舰前来迎战，朝鲜水师见敌众我寡，无法扩大战果，连箭都不敢放，只能撤退至闲山岛。
作为元均上级的朝鲜都元帅权栗见元均不亲自前往作战一线，朝鲜军在熊川附近海域的战斗又撤退，大怒之下，认为元均作为将领却畏敌如虎，兵怂怂一个，将怂怂一窝，于是权栗召唤元均到昆阳，七月十一日，权栗到达昆阳，狠狠杖责了元均，怒斥他说：“国家待汝以高秩者，徒为安享富贵之乐耶？孤负天恩，汝罪罔赦！”
权栗杖责元均逼迫他出兵，元均被杖责以后受了很大刺激，当晚返回了闲山岛，七月十四日率领朝鲜水师倾巢而出，前往日军的大本营釜山。
庆尚道长期被日军占领，作为朝鲜水军主力的全罗道水师在六月十五日点兵时一共只有5000多人。
朝鲜军前往釜山时，日军已经占领了沿海的多处险要之地，在发现朝鲜水军出动以后，相互传报，很快就做好了应对，朝鲜水军深入釜山一带地区后，日军在沿海山地上居高临下，传报各部日军集结。
