咸镜道的加藤清正军团成为了明军重点关注对象，一旦他率部袭击平壤的话，会对在朝明军极端不利。然而可喜可贺的是，他并不敢这么做。除了对明军的畏惧以外，更多是他现在自身也遇上了大的麻烦。
前面提到过日军在朝鲜的税收问题，在日本人眼里已经是仁政的四公六民在朝鲜人眼里却是前所未有的暴 政。朝鲜底层虽然痛恨两班贵族地主的残暴统治，但是他们没想到赶走了朝鲜贵族的鬼子却有过之无不及，这也打破了他们眼中改天换地的”皇军“的形象。而对于地方豪族来说，鬼子本来就是破坏者，保卫自己的领地那是理所当然的。
自日军于万历二十年五月三日占领王京以来，后方就一直不稳定。 在庆尚道沿海的釜山浦至王京之间，朝鲜义兵群起，时常袭击日军，使 日军的通道堵塞，补给路线被截断。为了镇压活跃在庆尚道的义兵，细 川忠兴、长谷川秀一等人在当年十月出兵，攻打庆尚道的晋州城，但是却打了败仗。“经略”庆尚道的毛利辉元，长期遭到义兵骚扰，甚至被迫 放弃了星州城。于是，王京的日军诸将就想将在咸镜道作战的加藤清 正、锅岛直茂召还回来，让他们击退庆尚道的朝鲜义兵。
加藤清正攻入咸镜道之时，对李氏政权不满的地方民众，捕拿地方军政长官争相投敌，咸镜道朝廷官员之中，“逃出者十无一二”。郑文孚因无事不用刑杖殴打下属民众，又常将书籍赠送给学生，因此在被叛乱者围捕，几乎要饿死荒野的时候，被校生池达源，藏匿与其家中。由于池达源居住在镜城最偏远的地方，郑文孚未被叛军搜到，所以当明朝军事干涉的消息传到镜城的时候，只有六品官职的郑文孚，反而成了镜城当地官职和声望最高的人。
“天兵将至，朝廷已判北界为逆窟，平倭后当首见讨伐。”西北堡万户高敬民，向该地民众传达明朝对日军侵略朝鲜，进行军事干涉的消息，以及李朝对咸镜道叛乱四起的态度。咸镜道距离明朝辽东镇距离不远，自然知道中国军队的真正实力，在得知中国出兵的消息之后，咸镜道内人心惶惶，唯恐遭到朝鲜政府的报复。借此机会，池达源伙同崔配天等人，私下串联校友和相识的军官，推举郑文孚为义兵将，集结了原咸镜道士兵和壮丁数百人，以前任万户姜文佑为先锋，于九月十六日进攻镜城。镜城守军是之前绑了捕朝鲜王子的朝鲜伪军，首领是被加藤清正任命为礼伯的鞠世弼。郑文孚军突然抵达，猝不及防的鞫世弼来不及通知日军，只得亲自带人登城据守镜城。池达源、崔配天及姜文佑等人，本是镜城当地地方豪族，而郑文孚所部士兵，也是镜城当地中上层良人地主。在明朝军事干涉和传言朝鲜事后报复的压力之下，本来对朝鲜并无多少忠诚镜城人，开始反对投日的鞫世弼。在郑文孚对鞠世弼通晓利害关系之后，亲手将镜城献给日军的鞠世弼，又亲手为朝鲜当地官员打开了镜城城门，并将兵使印交还给郑文孚。这是咸镜道第一次有组织的大规模义军活动，但是其成分是低级文官郑文孚为首，由逃亡的各地在职、离职官员，地方豪族，前叛军所组成。十月中，咸兴武官柳应秀、李惟一也乘势而起，在咸兴以北高迁社起兵，会宁儒生申世俊起兵，斩杀鞠景仁，咸镜道随即大乱，使得本来兵力就不足，只能屯驻与大城的日军捉襟见肘。
咸镜北道除安边加藤清正本部外，吉川驻军最多。10月30日，郑文孚领三千余名义军前往进攻吉川部日军，临行前，以国贼尚在阵中为由，擒斩鞠世弼等十三人，掌握了原叛军的军权。当时屯居吉州的加藤安政正在四处扫荡吉州周边村社，其中一支部队在劫掠明川海仓。十一月十五日，郑文孚占据吉州城东五里的长德山，并在山西预设伏兵，待回城日军前来围山放铳之际，以骑兵冲击日军阵形，将其赶入涧谷中。谷口的伏兵乘势发射火炮，将这股日军阻截在谷内，随后大军云集，将其包围。当晚下了大雪，气温骤降，御寒不足的日军无力再战，次日被朝鲜斩杀六百余人，吉州日军八名守将之一的山口与三右卫门，也在与此战中阵亡。吉州日军不过一千五百人，此战损失超过三分之一，人员损失巨大的日军只得闭城死守，而朝军难以攻城，只得四面围城。长德山之战，也是朝鲜人斩首日军最多的一次战斗。除了吉州的加藤安政，还有九鬼广隆也在端川被朝鲜官军围困
万历二十一年一月初，加藤清正收到了三奉行的信件以后，犹豫着是遵循三奉行的退兵命令，还是去解救吉州、端川的家臣， 他为此前往锅岛直茂在咸镜道的大本营咸兴，与锅岛直茂商量对策。锅岛直茂认为应该优先执行三奉行的命令，立即从咸镜道撤兵，舍弃掉吉 州、端川被围的士兵，任其自生自灭。但是加藤清正坚持出兵去救援吉州、端川的部属，等自己人全部获救以后再从咸镜道撤退。锅岛直茂也只好表示同意。
一月十五日，加藤清正和锅岛直茂各自派出了救援队前去救援被围在端川、吉州两地的日军。 端川守将九鬼广隆等人正以500兵力苦守。由于端川城内的兵粮已经严重不足，他们不得不出城掳掠。与端川日军对峙的是端川郡守姜灿、 高岭佥使柳擎天，他们率领的朝鲜步兵无法击退四处掳掠的端川日军，无计可施的情况下，姜灿只好亲自出面， 去向正在包围吉州的咸镜道义兵大将郑文孚请求援兵。
一月二十二日，郑文孚派出的援军到达端川，与姜灿的部队会合。次日朝鲜军在附近设伏，让端川官军作为饵兵在端川城外引诱城内日军出战。城中留守的日军因为此之前屡次打败端川朝鲜军，所以非常轻敌，200名日军士兵没有什么顾忌，就从城内杀了出 来，朝军立刻诈败，将日军引向埋伏圈。其中，一些朝鲜军掉队，被追上来的日军杀死，这让日军更加轻敌，最终进入了朝鲜军一开始设置好的埋伏圈内。霎时伏兵齐出，对着日军疯狂射箭。日军仓皇失措地向朝鲜军乱放铁炮，但都没有打中目标，于是向端川城落荒而逃。朝军一路追击至端川城下， 总共射杀了60余名日军士兵，剩下的日军逃入了城中。
