决定弃守王京城后，临海君由领府事金贵荣等人陪同前往咸镜道，顺和君前往江原道，柳成龙被李昖命令留守王京，李恒福等人制止，最终改为李阳元留守。国王准备逃走的消息传来，王京城内人心涣散，官吏百姓也开始逃窜，甚至城内连打更的人都没了。申砬死后，朝鲜已经没有大将，面对逃回来的李镒，国王也没有追究他的责任，命令他一起去平壤。
四月三十日，天刚一亮，朝鲜国王李昖一行人就出逃王京。李昖和世子光海君骑马，王后乘轿子。这一天下了一整天的大 雨，王后和妃嫔们到达王京西大门外的弘济院时，因为雨下得太大，轿子不利急行，都换上了马。在后方，百官痛哭着，冒着大雨徒步逃走。从行的王公贵族、文武官员、仆从加起来还不到100人，相当窘迫。城内的底层贱民奴婢趁机作乱，攻入掌隶院刑曹，焚毁了存放的公私奴婢文籍，随后又攻进内帑库劫掠财务，纵火烧了宫室，大量手工艺品和书籍文件通通被毁，甚至王子的住所也被烧掉。这些人早就受够了上层人的压迫，鬼子的到来似乎给了他们翻身的机会。
傍晚，逃跑的国王一行人走到临津，大雨还在下，已经很难分辨方向，现在他们担心追兵，于是拆毁了这里的房屋制造木筏，渡河西行，于三更时分抵达东坡驿，牧使具孝渊设宴款待一行人，逃难的人群饿了一天，已经顾不上形象，纷纷抢夺饭菜，如同恶犬一般。当晚，李昖一行人在这里留宿。但是队伍已成惊弓之鸟，半夜，士兵几乎逃散殆尽，很久之后队伍才安定下来。
五月一日拂晓，李昖召见承政院都承旨李恒福，向他询问接下来的对策。李恒福回答道：“可且驻驾义州，若势穷力屈，八路俱陷，则便可 赴诉天朝。”他的意思是，让李昖一直逃到与大明交界的义州，如果连义州都保不住，那就只能逃入大明境内了。左议政尹斗寿则主张退守咸镜道：“北道士马精强，咸兴、镜城，皆天险之恃，可逾岭北行。”柳成龙也反对李恒福，他对李昖说：“不可，大驾离东土一步，则朝鲜非我有也。”李昖告诉柳成龙，内附大明本身是他的意见，柳成龙仍然反对。李恒福认为逃去咸镜道，前有日军，后有女真，万一出事则无路可逃，尽管如此，柳成龙仍然不同意，双方争执不下。李昖只能先逃往开城。
次日，咸镜道南兵使申硈率亲兵进驻开城，午时，李昖在南门召集百官讨论应对政策，开城朝鲜军只有930余人，根本无力抵抗。而此时日军尚未攻打王京的消息传来导致群情激愤，党争再次上演。李昖只好把柳成龙罢官，命申硈前往王京侦察。
五月三日，黄海道士兵6000多人集结于开城，和宗庙守仆发生纠纷，眼看即将兵变，李昖只能杀了守仆，这下，王室的权威荡然无存，李昖也放弃了据守开城，逃往平壤。
朝鲜人还在瞎折腾，日军可不惯着他们，加藤清正的第二军团登陆后，占领了庆州，又进入永川郡，一直抵达龙宫县，前往小西行长占领的忠州，黑田长政率领第三军团攻陷了金海，昌原府，星州牧，又击溃了郑起龙等人的联军，击杀了义军将领张智贤，占领青山，进驻清州。加藤清正于四月二十九日抵达忠州，落后了一天，没能赶上弹琴台之战，和小西简单商议后，二人向王京进攻。
然而天气恶劣，搞的李昖等人狼狈不堪的大雨也让日军第一军团迷了路。五月三日，加藤率第二军团抵达汉江南岸，而朝鲜人早已把船只迁到北岸，加藤军中的游泳高手渡过汉江抢回好几条船。此时金命元率1000余人在济川亭，第二军团日军约有23000人，眼见日军势大，朝军战意全无，日军用火绳枪射击济川亭，金命元见军心涣散，下令把重武器投江，脱下官服逃往临津，李阳元听说汉江守军崩溃，自知守不住王京，弃城逃跑。而小西行长因为迷路，五月二日才到达骊江，暴雨导致江水上涨，兵马很难泅渡，江原道助防将元豪在对岸把守干扰日军，当天，只有小西行长，宗义智等人率先锋军渡河，经过一天高速行军，在晚上8点赶到王京城东门，确认无人防守，破坏水门进城。此时加藤清正还在南门外。
加藤清正是武士出身的大名，也是贱岳七本枪之一，在丰臣秀吉手下也是战功赫赫，在那个看重血统的日本，他看不起商人出身的小西行长，所以不愿意落后，于是命人向丰臣秀吉报告已经入城，丢下大军进城。双方都为了抢功丢下大部队，也是奇葩。只是，小西是入城后才报的功，落后于加藤，导致加藤被记为头功，二人算是结下了梁子。而小西的后续大部队直到五月四日才渡过骊江。
四月十三日登陆釜山，五月三日攻陷王京，仅仅半个多月，日军势如破竹，以步兵为主的军队达到了日行50里的速度，愣是打出了闪击战一样的效果，捶的朝鲜人措手不及。随后，日军各个军团纷纷进驻王京。城内朝鲜人要么乖乖当良民，要么就被朝奸举报，被日军屠杀。随后，日军在占领区安营扎寨，设防驻守，准备后续的作战。
