伏威还在江淮时，辅公祏一方面顾念旧情，另一方面也慑于伏威在江淮军中无人能及的威望，尚没有公开反叛。伏威一走，他便按捺不住，与心腹密友道士左游仙密谋夺权。
原本按照伏威的安排，让其义子王雄诞留镇江淮，执掌兵权，弹压人心，唐室对此也予以认可。王雄诞对杜伏威忠心不二，杜伏威走后，辅公祏派人对其旁敲侧击、拉拢利诱，但他不为所动，牢记义父嘱托，一心效忠大唐。
可惜此人乃一介武夫，虽勇冠三军，却没什么心机谋略。辅公祏见软的一招不灵，便心生一计，伪造了一封杜伏威从京师写给王雄诞的书信，信中斥他独揽江淮兵权、事事自作主张，责其是否对义父生出二心。
辅公祏与杜伏威自幼 交好，二人非常熟悉，辅公祏摹仿杜伏威书信，不但笔迹毫无破绽，连语气都如出一辙，不由得王雄诞这粗豪武夫不信。这王雄诞为人耿直、脑筋不会转弯，明明江淮军的兵权就是义父刻意亲授于他，并叮嘱他提防辅公祏有异举，怎会突然又责其独揽兵权自作主张？如此前后矛盾，雄诞本应去信向伏威求证，他却在读了信之后，为义父怀疑自己的忠诚伤心欲绝！为了避嫌，竟从此托病在家闭门不出，不再沾手军务，欲以实际行动证明，自己对义父绝无背叛之意。
但其政 治幼稚行为正中辅公祏下怀，辅公祏趁机接管了江淮军大权。
见伪造杜伏威书信之计如此顺利，辅公祏索性再伪造一次，这回更是直接伪造杜伏威密令，称他在长安遭唐主薄待，被困京师失去人身自由，欲重返江南却不得脱身，命辅公祏起兵北上京师相救。
辅公祏在江淮军中素有人望，乃是仅次于杜伏威的二号人物，众人今见又有此杜伏威密令，群情汹涌之际不作细想，一致拥戴辅公祏兵变。
王雄诞闻其生变，这才知上当，追悔莫及！入见辅公祏劝道：“今天下方定，吴王又在京师，大唐兵威所向无敌，为何要谋反自求族灭？”
辅公祏反过来劝王雄诞跟自己一起干，雄诞誓死不从，并直言辅公祏不久必败，说道：“与其为了延长百日之命陷于不义，不如坦然就死保全名节。”
辅公祏见王雄诞不肯听命，命人将其缢杀。
于是，距离伏威随世民入朝不过一年多，武德六年八月，辅公祏在丹阳自立为帝，国号“宋”，年号天明，以左游仙为兵部尚书、东南道大使、越州总管，令其负责监造武器，筹备粮饷。
消息传至京师，吴王伏威无以自明！情急之下竟一病不起。
太子建成力荐赵郡王李孝恭率军平叛。于是武德下诏，命襄州道行台仆射、赵郡王李孝恭率领水军从九江直趋江州，命岭南道大使李靖率交、广、泉、桂四州部众趋宣州，怀州总管黄君汉从谯州、亳州出兵，齐州总管李世勣从淮、泗出兵，四路人马协同平叛。
武德又下诏，加封天策上将、秦王世民为“江州道行军元帅”，遥领各路大军名义“总指挥”，实则因北方突厥骚扰等事务，世民自七月起就受命北巡并州，武德此时并未调世民亲赴南方前线指挥平叛，但关键时刻，他还得借助于被唐军上下称誉为大唐“战神”的这个二儿子巨大的号召力，来鼓舞士气，威慑敌军。
武德六年下半年，不愿与大哥发生正面冲突的世民便乐得远离京师，一直待在并州巩固北疆防御，他研究了并州长史窦静请于太原置屯田的建议，认为可行，便上疏父皇请增置屯田于并州之境，大唐“边防军”战时御敌，平时则屯田，亦兵亦农，以省军粮馈运。此后屯田颇有成效。至当年底，世民方奉命返回京师。
这期间，南方各路平叛大军汇聚江淮，由李孝恭实际总节度，李靖为辅，协同讨伐辅公祏。李孝恭并上奏皇帝，征召吴王伏威义子、左领军将军、越州总管阚棱至前线随同大军出征。
李孝恭有李靖、李世勣助力，又有阚棱充任帐前先锋，这一仗打得基本不费力气。阚棱与王雄诞在江淮军中并称“双雄”，阚棱往昔在江淮军中负责整肃军纪，有违纪者无论亲疏一律法办，在江淮军中威望极高。武德五年他随同义父入朝，被任命为左领军将军、越州总管。此时阚棱惦记身在长安的义父，为向朝廷表明他二人绝无异心，两军对垒之时，阚棱直接猛冲过去，摘掉头盔向江淮军大喝：“尔等不认识我了吗？何敢来战！”
江淮军见对垒的竟然是他，立马军心大乱！甚至有士卒扔下武器下拜，就此投降唐军。
在李孝恭等诸路大军重兵围剿下，辅公祏节节败退，覆灭指日可待。而留在京师的吴王伏威，日子自然不好过。武德七年三月的一日，杜伏威在长安暴卒。
杜伏威去世时年仅三十余岁（注释），外界对其暴卒感觉突然，颇有猜测。伏威表面的死因，是因进京后，养尊处优，虽说名义上是仅次于秦王世民的大唐第四号人物，然伏威心里明镜也似，自然知晓自己的身份是不便干政，便在宅中潜心炼丹修道。据吴王病重时武德皇帝派去诊视的御医事后上奏，言吴王是服食丹药时，误服过量云母，中毒而亡。只怕中毒是有，但如何中毒，就不得而知了。
秦王世民闻讯，深悼惜之。他坚信吴王绝无叛唐之心，完全是辅公祏自作主张，假托伏威之名。秦王亲临吴王府邸吊唁，并厚赐家属。
注释：有杜伏威墓志出土，墓志里明确说其去世时年四十一岁，然史载其十六岁落草，以去世时四十一岁推算，则其落草为开皇年间，似乎做“强盗”时日太久，因此此处设定其去世年龄为三十岁附近，则其十六岁为大业年间农民起义暴发之时。
