一切准备就绪，大业十三年十一月十五日，李渊大集隋文武官员，拥立代王杨侑即位于大兴殿。十三岁的杨侑穿着不合身的龙袍，战战兢兢，任人摆布，在震耳欲聋的“吾皇万岁！万岁！万万岁”声中，被推上皇帝宝座，改元义宁，遥尊远在江都的杨广为太上皇。任李渊假黄钺、使持节、大都督内外诸军事、尚书令、大丞相，进封唐王。以武德殿为丞相府，改“教”称“令”，白天在大兴殿东侧的虔化门处理政务。
紧接着皇帝杨侑下诏：军国事务、各级文武官员任免、赏功罚过，皆归丞相府处理；皇帝只管郊祀天地、四时禘祫。也就是说，除了祭拜他杨家祖先，皇帝概不管事，一应军国大事俱由唐王李渊处理。
李渊踌躇满志，觉得自己俨然“挟天子以令诸侯”的曹孟德，大力封赏亲族、亲信，原大将军府僚属一律升任大丞相府僚属，仍以裴寂为长史，刘文静为司马，前尚书左丞李刚为相府录事，李渊妻族窦威为司录参军，窦轨为谘议参军；授建成为抚宁大将军，世民为京兆尹，各自置僚属；又特封三女为平阳郡主，准其自置幕府，领其部众，并升郡主夫婿柴绍为左翊卫大将军，与郡主同领兵马；宗室李神通、李孝恭、李孝基、李神符等俱授官爵。
接着，李渊告祭祖庙，追谥祖父李虎为景王，父李昞为元王，夫人窦氏为穆妃。
李渊得意之余，却有一件大事令其左右为难，无从决断，这便是选立世子一事。
李渊诸子中，三郎玄霸与五郎智云俱已不在，四郎顽劣，又是幼子，世子自然是在大郎建成与二郎世民中间选取。若按“立嫡以长”原则，自当立大郎建成。大郎脾气颇类自己，遇事稳重，亦有文武之才。天下的老子都希望儿子象自己！李渊对颇有乃父之风的建成甚为满意，近几年来自己在外征战南北，家眷均嘱托建成照料，建成也颇为尽责。立大郎为世子似乎没有问题。
然而知子莫若父，偏偏李渊了解自己有个太出色的次子世民。如果说李渊对大郎建成是信任倚重，对二郎世民则更是宠爱有加。这么多年，李渊转战南北，诸子中惟有世民几乎不离左右，这本是李渊的刻意安排，他实在太爱惜这个儿子自幼表现出的天资过人，文武兼备，有心将其培养成为将来威震天下的一代名将。世民亦果然不负父望，每每危急关头，为父排忧解难，让李渊觉得，乱世之中有子若此，也足可安慰。太原起兵以来，桩桩件件，皆离不开世民的组织、谋划。兵进关中一路，世民所表现出的机智勇武与统帅才能，已在官兵心目中树起崇高威望。若论立贤、立功，立二郎为世子亦不为过。何况李渊心中还有一段鲜为人知的秘密。
世民四岁之时（实足年龄两岁），李渊尚未为其取名，家中上下只以“二郎”呼之。一日家里来了一位据说善于相术的方士，那方士看了李渊的相，就说：“公为贵人，当有贵子。”正好万氏带着小二郎在一侧玩耍，李渊即命抱来，那人一见之下大惊，赞道：“此子龙凤之姿，天日之表，贵不可言！年及弱冠，定能济世安民。”李渊因取“济世安民”之意，为儿子取名“世民”。
若那方士的说法准确，二郎真有天命？若立二郎为嗣，李渊觉得对大郎建成未免有失公允；可是若立大郎，李渊又难舍二郎世民卓越的文韬武略，将来削平群雄，一统天下，多半要靠此子，他又如何给世民一个公平？
率两位爱子告祭祖庙之际，李渊心情复杂，恨不得祖先能够指点迷津。
此时却又传来火急军情，那起于陇西号称“西秦霸王”的薛举，以其子薛仁果（注释）为先锋，领军号称三十万欲来争抢长安，前锋已接近扶风一带。
李渊忙召集众文武将佐商议对策，敦煌公李世民主动请缨，愿率军迎战。李渊准其所请，命其于阿城调集兵马。
武德殿内，李渊正在灯下翻阅世民日间递给他的一道上书。
看着看着，李渊激动起来，站起身来回踱着步，一边思考着。
上书中，世民对时局作了鞭辟入里的分析，提出统一中原的方略，自然是他与房玄龄反复计议的，外示谦和，内聚实力，巩固关中，经略巴蜀，订立法度，明确刑赏，广揽贤士，识拔将帅等等一系列措施，李渊心中大为赞赏。
沉思良久，李渊吩咐侍卫，随他去京兆府世民所在官邸。
世民闻听父亲驾临，忙将父亲迎入，问道：“大人有事，派人传唤孩儿即可，何必劳驾亲临？”
李渊挥退了侍从，只剩下父子二人。
李渊执世民之手道：“适才看了我儿上书，为父想与二郎当面商讨一二，想起二郎过两日就要离京，故此特来一叙。”
世民道：“明日孩儿将京兆府事作个交代，后天即去阿城调集兵马准备出征。”
“嗯。我儿此番出征，定立奇功。为父在想，此番若能一举击溃那薛举，待我军在关中立稳，下一步就由你和大郎联手出征洛阳。‘擒贼擒王’，如今天下诸侯，要以瓦岗李密势大，我等若趁其现困于坚城之下，与洛阳王世充夹击，一举削平李密，其余诸豪强必望风震骇，投顺我大唐。反之，我若坐视不出，任由那李密拿下东都，其威势将震于天下，关东群雄尚有谁与争锋？其势必挟战胜之余威，统百万之众，西入关中。到那时，我父子岂能抵挡？至于我儿上书中所言巴蜀之地，无甚豪强，派一二偏将，不难平定。”李渊豪气盈胸。
注释：史实考：《旧唐书》、《新唐书》为薛仁杲，但昭陵石刻与司马光《资治通鉴》为薛仁果，今从昭陵石刻与《通鉴》，改初稿“薛仁杲”为“薛仁果”。
